Page 15 - SOP Uji Biomolekuler untuk PMK

1x suhu 96°C selama 1 menit
25x suhu 96°C selama 10 detik, 50°C selama 5 detik
1x suhu 60°C selama 4 menit
Hold suhu 4ºC ∞

5.2.7 Purifikasi Reaksi Sekuensing

1. Ambil SAM solution sebanyak 90 µL, lalu tambahkan 20 µL BigDye XTerminator™ bead
solution.

2. Tambahkan 20 µL produk cycle sequencing.
3. Vortex selama 30 menit.

4. Sentrifus 1000 g selama 3 menit.
5.2.8 Sequencing

Masukkan sampel yang telah terpurifikasi sebanyak 10 µL ke dalam mikroplate, letakkan pada
mesin sequencer, lalu running hingga selesai. Raw data berbentuk abi files selanjutnya
dianalisa bioinformatika.

6. RETENSI DAN PEMUSNAHAN CONTOH UJI
6.1. Contoh original (plasma, swab, Oesophageal-Pharyngeal (OP), jaringan epitel, daging, RNA
dan cDNA) yang diterima di simpan di suhu -20°C (freezer) sampai contoh di uji.

6.2. Contoh dengan hasil uji negatif dimusnahkan 6 (enam) bulan setelah pengujian. Apabila

terdapat contoh dengan hasil positif maka dikoleksi dan disimpan pada -80°C (Deep
Freezer) atau dimusnahkan sesuai dengan perjanjian.

6.3. Contoh RNA hasil ekstraksi di simpan di freezer -20°C. Apabila terdapat contoh RNA dengan
hasil uji positif maka dikoleksi dan disimpan di disuhu -80°C (Deep Freezer).

6.4. Musnahkan contoh original dengan autoclave dan incinerator

7. JAMINAN MUTU/QUALITY ASSURANCE

Setiap pengujian wajib menyertakan paling sedikit 1(satu) kontrol positif, 1 (satu) kontrol negatif
dan 1 (satu) NTC (Non Template Control). Hasil pengujian dicatat dalam sebuah lembar kerja

pengujian laboratorium dengan mencantumkan jenis kontrol positif dan negatif yang digunakan.
Hasil kontrol positif dari setiap pengujian dicatat dan dievaluasi secara berkala apakah kontrol

yang digunakan masih dapat di gunakan dalam pengujian atau harus diperbarui.

SOP UJI BIOMOLEKULER PMK Pusvetma 2020 Rev 2024 | 15